Якою може бути проблема, якщо групи не з'являться в Western Blot?

Якою може бути проблема, якщо групи не з'являться в Western Blot?
Anonim

Відповідь:

Багато …

Пояснення:

Є багато причин, чому групи можуть не з'являтися на західному блоті. Чи поєднувалися зразки та антитіла в минулому?

Нижче наведені лише деякі, які я можу припустити на даний момент, що може призвести до того, що смуги не з'являться:

  1. Перенесли білок з гелю? Спробуйте пофарбувати мембрану чимось на зразок ponceau S або amido black, щоб побачити, чи присутні смуги. Іноді ви можете бачити білкові смуги на мембрані, змочуючи її і тримаючи її під кутом до світла.

  2. Чи працюють первинні антитіла? Це важко перевірити, і єдиний спосіб, яким ви можете, полягає в тому, щоб включити позитивний контроль, де ви знаєте, що у вас є цікавий білок. Якщо у вас є якийсь білок, що цікавить вас, ви можете спробувати помістити його на західну блоттерную мембрану (тобто ви не запустите гель) і побачите, якщо ви отримаєте результат, якщо обробити мембрану, як якщо б вона була західним блотом.

  3. Чи розпізнає вторинне антитіло первинне антитіло? Знову ж таки, важко перевірити. Про єдиний тест, який ви можете зробити, це тест на спот, згаданий вище в 2.

  4. Чи працює "система виявлення"? Залежно від способу виявлення, який ви використовуєте, ви можете спробувати перейти в деякі з вторинних антитіл, щоб побачити, чи працює розчин виявлення, а також запускає агент / фермент на вторинному антитілі. Тобто, чи можна викликати реакцію тільки з вторинним антитілом?

Нарешті, вона може бути такою ж простою, як одне з рішень, що використовуються під час зондування ділянки, що складається неправильно. Наприклад, якщо концентрація солі є неправильною в буфері, то це може викликати вивільнення антитіл з блоту. Те ж саме відбувається, якщо рН буферів буде неправильним.

"Найдивніша" причина для західного помарки не працювала, що я особисто пережила, коли ми змінили постачальника сухого молока, який ми використовували для блокування мембрани. Порошок з нового постачальника містив фосфотирозин фосфатазу, яка видалила всі групи фосфатів, які ми намагалися виявити за допомогою нашого анти-фосфотирозин антитіла.