Чому ми використовуємо негативний контроль у ПЛР?

Чому ми використовуємо негативний контроль у ПЛР?
Anonim

Відповідь:

Дивись нижче

Пояснення:

ПЛР працює на основі матричної ДНК. Давайте скажемо, що ви тестуєте на ВІЛ (ВІЛ - це РНК-вірус, але коли він переходить у клітину, він перетворюється на ДНК… тому в зараженій клітці буде ДНК ВІЛ). Використовувані праймери зроблять продукт (амплікон), який відповідає частині ДНК ВІЛ. Якщо ви бачите цей амплікон, то у вас є присутність послідовності ВІЛ ….. але якщо у вас немає негативного контролю, ви можете мати забруднення.

ПЛР є надзвичайно сенситивною. Є багато рішень, що використовуються в ПЛР (вода, буфер, dNTPs, фермент) … і всі вони можуть легко заразитися ДНК з інших зразків, або навіть з амплікону, який був зроблений в реакції, яку ви зробили вчора. Отже, якщо у вас є зразок ДНК пацієнта Х і ви перевіряєте на наявність ВІЛ за допомогою ПЛР, праймери ПЛР можуть зробити продукт з ДНК ВІЛ у зразку ДНК пацієнта Х (якщо ця особа має ВІЛ), або вона може відмовитися від забруднення. Але ви не можете сказати, що це від забруднення або від ВІЛ в ДНК пацієнтів.

Таким чином, ви запускаєте контроль води. Трубка 1 розміщує всі компоненти реакції, а для ДНК додається тільки вода. Це негативний контроль. НІЧО не слід посилювати тут. У трубі 2 ви поклали всі компоненти реакції і ДНК пацієнта Х. Якщо ви отримаєте продукт тут, (і нічого в трубці 1), пацієнт Х, ймовірно, має ДНК ВІЛ у своїй ДНК. Якщо ви отримуєте продукт як в трубці 1, так і в трубці 2, ви маєте проблему забруднення, і ви не можете сказати, чи є ВІЛ у зразку пацієнта хворобою або від зараження.

Таким чином, ви завжди виконуєте контроль води (вода замість ДНК).