Чому більшість рестрикційних ферментів розрізають на палиндромной послідовності?

Чому більшість рестрикційних ферментів розрізають на палиндромной послідовності?
Anonim

Відповідь:

Тому що це більш ефективно.

Пояснення:

Ферменти, такі як рестрикційні ферменти, повинні розпізнавати дуже специфічну послідовність для виконання свого завдання. Він зв'язується з ДНК тільки в одній конкретній конфігурації. На щастя! тому що ви не хочете "Pacman", який ріже ДНК у випадкових місцях.

ДНК є дволанцюжкової, тому вона має «дві сторони», до яких може зв'язуватися фермент. Паліндромна послідовність однакова назад і вперед з обох сторін (див. Малюнок нижче). Це означає, що фермент розпізнає послідовність незалежно від того, з якого боку фермент наближається до ДНК.

Палиндромная послідовність також збільшує ймовірність того, що обидві нитки ДНК будуть розрізані. Можливо навіть, що два ферменти працюють як димер, щоб розрізати палиндромную послідовність, ще більше підвищуючи ефективність.

Остання причина була важливою у боротьбі між вірусами та бактеріями. Бактерії розвивалися для того, щоб «відключити» віруси, що націлюють бактерії (бактеріофаги), використовуючи ферменти рестрикції, які зв'язуються з цими палиндромними послідовностями. Різання обох ниток ДНК шкодить вірусу більше, ніж різання однієї нитки.